Музей народно-прикладного искусства открыт в 1999 году. Здание, в котором располагается музей, – одноэтажный деревянный дом с мезонином классического стиля, украшенного ажурной резьбой. Постройка датируется 1907 годом. До 1917 года дом принадлежал подрядчику земской управы П. Лоханову. В разные годы в доме располагались кантонный исполком Совета крестьянских и солдатских депутатов, ремесленная школа. Сегодня дом П. Д. Лоханова – историко-архитектурный памятник Республики Марий Эл и объект культурного наследия, охраняемый государством.
2 ноября 2022 года в Музее народно-прикладного искусства состоялось торжественное открытие новой экспозиции, приуроченной к Году народного искусства и нематериального культурного наследия народов России. В основу концепции новой экспозиции была положена следующая идея: «Дом Лоханова: от истории человека и его дома к истории народного мастерства». Её автором является старший научный сотрудник Национального музея РМЭ им. Т. Евсеева М. А. Гордеева. В мероприятии приняли участие специалисты в области декоративно-прикладного искусства, народные мастера Республики Марий Эл, обучающиеся, сотрудники и друзья музея. Зрителям были представлены обновлённые выставочные залы, где воссоздан интерьер царевококшайского купеческого дома начала XX века, а также выставки, посвящённые деятельности вышивального цеха артели «Труженица». В одном из залов музея разместилась выставка памяти Елены Аркадьевны Кожиной (1957–2005) – художника декоративно-прикладного искусства, члена Союза художников России, лауреата Государственной премии Республики Марий Эл имени А. В. Григорьева. Один из залов музея посвящён творчеству мастеров, носящих почётное звание «Народный мастер традиционных художественных промыслов и ремёсел Республики Марий Эл». Сегодня в нашей республике пятеро человек удостоено этого звания! Проект дополнили богатые фондовые материалы из фондов Национального музея им. Т. Евсеева, личные вещи мастеров декоративно-прикладного искусства, фото и видеоматериалы.
По экспозиции и выставкам проводятся тематические экскурсии с учетом категории посетителей, разнообразные образовательные, культурные программы.
Эта, а также другие выставки музея доступны для людей с ограниченными возможностями здоровья